Línea 2 UNIDAD B
Una visión completa de los organismos biológicos requiere la integración de información biológica separada (ecofisiología, variaciones, expresión génica, metagenómica, fenología, analítica…). Esta información debe centralizarse e integrarse para permitir una mejor comprensión de las respuestas adaptativas de las plantas al estrés con el fin de seleccionar o desarrollar cultivos más tolerantes.
Objetivo
Seleccionar cultivos vegetales (como los cítricos, el olivo o incluso el tomate) mejor adaptados al cambio climático, principalmente por el estrés salino y la sequía.
Se desarrollan y explotan flujos de trabajo bioinformáticos automatizados, incluido el aprendizaje automático, para relacionar genes, microbiota, fenotipos y funciones, y seleccionar los rasgos que deben introgresarse en los cultivos para afrontar con éxito el estrés abiótico fomentado por el cambio climático.
- M Sheikh-Assadi, R. Naderi, S. Alireza Salami, M. Kafi, R. Fatahi, V. Shariati, F. Martinelli, A. Cicatelli, M. Triassi, F. Guarino, G. Improta, M.G. Claros (2022) Normalized workflow to optimize hybrid de novo transcriptome assembly for huge-genome non-model species: a case study in Lilium ledebourii (Baker) Boiss. Plants-Basel 11(18): 2365. DOI: 10.3390/plants11182365
- Romero-Puertas, Maria C; Peláez-Vico, María Ángeles; Pazmiño, Diana; Rodríguez- Serrano, María; Terrón-Camero, Laura C.; Bautista, Rocío; Gómez-Cadenas, Aurelio; M.G. Claros; Leon, Jose; Sandalio, Luisa M (2022) Insights into ROS-dependent signalling underlying transcriptomic plant responses to the herbicide 2,4-D Plant, Cell & Environment 45(2), 572-590. DOI: 10.1111/pce.14229
- P Seoane, M Espigares, R Carmona, A Polonio, J Quintana, E Cretazzo, J Bota, A Pérez-García, JD Alché, L Gómez, M.G. Claros (2018) TransFlow: A modular frame- work for assembling and assessing accurate de novo transcriptomes in non-model organisms. BMC Bioinformatics 2018, 19(Supp 14): 416. DOI: 10.1186/s12859-018-2384-y
- MJ Jimenez-Quesada, R Carmona, E Lima-Cabello, JÁ Traverso, AJ Castro, M.G. Claros, JD Alché (2017) Generation of nitric oxide by olive (Olea europaea L.) pollen during in vitro germination and assessment of the S-nitroso- and nitro- pollen proteomes by computational predictive methods. Nitric Oxide 68, 23-27. DOI: 10.1016/j.niox.2017.06.005
TED2021-130015B-C21
Convergencia de la transición ecológica y la digital en la oleicultura inteligente: el caso del estrés salino de olivo (DIGIOLIVE). SP1 Altas de expresión del olivo (OXA) para interrogación prospectiva del olivo en estrés salino.
IP: M.G. Claros
2023
Proyectos de Transición Ecológica y Transición Digital 2021, AEI-MICIN
UMA20-FEDERJA-029
Análisis bioinformático de polimorfismos y expresión génica en los tejidos reproductivos del olivo (Olea europaea) como fuente de marcadores de interés agroalimentario e inmunitario (BioInfOliv)
IP: M.G. Claros
2014-2020
Programa Operativo FEDER Andalucía 29/10/2014-2020 para Grupos Consolidados
PID2020-113324GB- I00
Modificaciones postraduccionales mediadas por metabolismo oxidativo y ácidos grasos en el polen, y su papel en la reproducción de plantas.
IP: Juan de Dios Alché Ramírez (EEZ-CSIC, Granada)
2020
AEI
P18-RT-1577
Identificación y caracterización de componentes de interés agroalimentario y carácter saludable en la semilla del olivo.
IP: Juan de Dios Alché Ramírez (EEZ-CSIC, Granada)
2020-2023
Proyectos de investigación competitiva orientados a los retos de la sociedad andaluza, Junta de Andalucía-PAIDI-2020
