A complete overview of biological organisms requires the integration of separate biological information (ecophysiology, variations, gene expression, metagenomics, phenology, analytical…). This information should be centralised and integrated to allow a better understanding of plant adaptive responses to stress in order to select or develop more tolerant crops.
LINE 2 – UNIDAD B
Objetivo
Select plant crops (such as citrus, olive or even tomato) better adapted to the climate change, mainly by salt and drought stresses.
Bioinformatic automated workflows, including machine learning, are developed and exploited to relate genes, microbiota, phenotypes and functions, and to select traits that must be introgressed in crops to successfully afford abiotic stresses fostered by climate change.
- M Sheikh-Assadi, R. Naderi, S. Alireza Salami, M. Kafi, R. Fatahi, V. Shariati, F. Martinelli, A. Cicatelli, M. Triassi, F. Guarino, G. Improta, M.G. Claros (2022) Normalized workflow to optimize hybrid de novo transcriptome assembly for huge-genome non-model species: a case study in Lilium ledebourii (Baker) Boiss. Plants-Basel 11(18): 2365. DOI: 10.3390/plants11182365
- Romero-Puertas, Maria C; Peláez-Vico, María Ángeles; Pazmiño, Diana; Rodríguez- Serrano, María; Terrón-Camero, Laura C.; Bautista, Rocío; Gómez-Cadenas, Aurelio; M.G. Claros; Leon, Jose; Sandalio, Luisa M (2022) Insights into ROS-dependent signalling underlying transcriptomic plant responses to the herbicide 2,4-D Plant, Cell & Environment 45(2), 572-590. DOI: 10.1111/pce.14229
- P Seoane, M Espigares, R Carmona, A Polonio, J Quintana, E Cretazzo, J Bota, A Pérez-García, JD Alché, L Gómez, M.G. Claros (2018) TransFlow: A modular frame- work for assembling and assessing accurate de novo transcriptomes in non-model organisms. BMC Bioinformatics 2018, 19(Supp 14): 416. DOI: 10.1186/s12859-018-2384-y
- MJ Jimenez-Quesada, R Carmona, E Lima-Cabello, JÁ Traverso, AJ Castro, M.G. Claros, JD Alché (2017) Generation of nitric oxide by olive (Olea europaea L.) pollen during in vitro germination and assessment of the S-nitroso- and nitro- pollen proteomes by computational predictive methods. Nitric Oxide 68, 23-27. DOI: 10.1016/j.niox.2017.06.005
TED2021-130015B-C21
Convergencia de la transición ecológica y la digital en la oleicultura inteligente: el caso del estrés salino de olivo (DIGIOLIVE). SP1 Altas de expresión del olivo (OXA) para interrogación prospectiva del olivo en estrés salino.
IP: M.G. Claros
2021
Proyectos de Transición Ecológica y Transición Digital 2021, AEI-MICIN
UMA20-FEDERJA-029
Análisis bioinformático de polimorfismos y expresión génica en los tejidos reproductivos del olivo (Olea europaea) como fuente de marcadores de interés agroalimentario e inmunitario (BioInfOliv)
IP: M.G.Claros
Octubre 2014 - 2020
Programa Operativo FEDER Andalucía 29/10/2014-2020 para Grupos Consolidados
PID2020-113324GB- I00
Modificaciones postraduccionales mediadas por metabolismo oxidativo y ácidos grasos en el polen, y su papel en la reproducción de plantas.
IP: Juan de Dios Alché Ramírez (EEZ-CSIC, Granada)
Enero 2014 - Diciembre 2017
AEI
P18-RT-1577
Identificación y caracterización de componentes de interés agroalimentario y carácter saludable en la semilla del olivo.
IP: Juan de Dios Alché Ramírez (EEZ-CSIC, Granada)
2020
Proyectos de investigación competitiva orientados a los retos de la sociedad andaluza, Junta de Andalucía-PAIDI-2020
